Семейство флавивирусов

Флавивирусы названы в честь прототипа вируса, вируса желтой лихорадки, flavus является латинским словом – желтый. Флавивирусы делятся на три рода, род флавивирусы, род пестивируса, и род гепацивирусов. Геномы трех родов близки по размерам (11 кб для флавивирусов, 12.5 кб для пестивирусов, 9,4 КБ для гепацивирусов) и организации. Такие вирусы, как пикорнавирусы, имеют геном, который содержит только одну ORF. Этот ORF переведен на длинный полипротеин, который обрабатывается при расщеплении в 10 или более полипептидов. Обработка предшественника полипротеина сложная процедура. Расщепление осуществляется путем сочетания один, два или три (в зависимости от вируса) вирус закодированных протеаз и двумя или более сотовыми протеазами. Структурные белки кодируются в 5′-концевой области генома (например, пикорнавирусы). Тем не менее, все члены флавивирусов окружены, в отличие от пикорнавирусов, белком и нуклеокапсидом двух или трех гликопротеиновым конвертом. Сотовые протеазы делают расколы, которые отделяют гликопротеины  в неструктурной области полипротеина, что, необходимо для репликации РНК. Расщепление путей в этом роде, описаны в подробнее дальше. Все члены флавививрусов кодируют серин протеазы с каталитической триады, состоящей из серина, гистидина, и аспарагиновой кислоты. Протеазы находятся в области, называемой неструктурной NS3, чуть выше по течению от геликазы. Кристаллическая структура денге протеазы вируса и гепатита С была выведена атомным разрешением и они обладают похожим химотрипсином, как и в случае для других вирусных сериновых протеаз. Фермент интересен тем, что второй полипептид необходим для деятельности, NS2B в флавивирусов и NS4A в ВГС. В атомной структуре протеазы вируса гепатита С в комплексе с областью NS4A необходимы для деятельности, это ясно, что NS4A является неотъемлемой частью сложенной протеазы. Таким образом, это вызывает недоумение, что протеаза состоит из двух  продуктов, а не из одной непрерывной полипептидной цепи. Флавивирусы кодируют только NS3 протеазы. Гепацивирусы  и пестивирусы кодируют вторую протеазу в NS2 регионе и  расщепляет между NS2 и NS3. Пестивирусы также кодируют 1/3 протеазы в N конечном полипротеине. Подробности структуры пестивирусов и гепацивирусов отсутствуют. Флавивирусы созревают в внутрицитоплазматических мембранах.

Ещё новости:

1. Семейство калицивирусов
2. Семейство HEPEVIRIDAE
3. Природа вирусов
4. Семейство пикорновирусов
5. Семейство ASTROVIRIDAE